由于一直藏在深闺，缺乏规划和治理，杏林湾片区过去鱼塘虾池遍布、水质恶化，而随着园博苑建设直到正式开园，这片水域得天独厚的自然优势被逐渐发掘，开发杏林湾片区成为市委市政府关于加快建设海峡西岸中心城市的重要部署，也成为厦门城市建设从岛内向岛外扩展的重要组成部分，如今这个仅次于环东海域开发面积的重点片区正蓄积美丽，等待着厚积薄发。
    
        随着杏林湾原本的自然景观优势被逐渐发掘，陈嘉庚先生“把杏林湾建成厦门的西湖”的心愿正被一点点地实现，当然，再造“西湖”更多的是基于设定一个高标准，因为谁也不愿浪费了这片得天独厚的美丽水域。
    
        在杏林湾片区开发初期，就有专家表示，虽然杏林湾今后的建设蓝图非常迷人，但是要保证开发的长期性，就要将水体的治理工作放在一个十分重要的位置，不能再走筼筜湖的老路。6平方公里的水域面积，无疑是杏林湾片区的精华所在，即使经过了前期的清淤和园博苑的湿地重建，水体的环境与过去相比有了很大的改善，但是上游的生产生活用水依然不断排入湾区，这一现象至今没有得到根本解决。
    
        杏林湾开发建设联合总指挥部办公室主任 吴志坚：村庄的生产和生活的用水 排入杏林湾 把它截住 就地用分散式的小型地排式的污水处理站就地处理后 中水再回用于绿地的灌溉 这个工程的目的是什么 目的就是净化杏林湾的水质 改善杏林湾的环境
    
        为了改善水质，杏林湾将启动截流工程，其中沿岸布设的截流沟和14座小型地埋式的污水处理站将成为污水截流的主力，而截流下来的污水经过处理变为中水后再作为绿化灌溉的水源，为此，园博园C片区和官任片区还将兴建两座日处理量5000吨和1800吨的污水处理站和污水提升泵站。
    
        杏林湾开发建设联合总指挥部办公室主任 吴志坚：特别是中科院环境研究所入住后 他们也和指挥部进行了对接 特别是要启动杏林湾水质检测项目 将来对杏林湾水质的改善将会起到很好的作用 
    
        杏林湾的水体治理费用超过亿元，而实际上这里的水域环境已经被看中，作为省市的水上运动中心，瞧，远处就有皮划艇选手正在杏林湾水域上练习。随着水体治理工程的推进，湾区景观工程也将拉开序幕，改变目前杏林湾景观只集中在园博苑的现状，正式以全景式绿色景观妆点杏林湾。
    
        厦门住宅建设集团有限公司副总经理 叶海水：原来市里面对这里的要求就特别高 特别要把这里的景观设计搞得水准比较高的项目 我们这个项目以后作出来的效果原来考虑是西湖 要做鼓浪屿 起码要有这么一个标准 一个档次 来考虑这个工程设计。（王继成 庄志刚）